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曾经有一对姐妹，从诞生的那一刻就被幸福包裹。她们的母亲非常疼爱两个自己创造出来的孩子，便把自己脖子上的项链取下来其中两片宝石注入了两个女儿体内。
至此，所有深海的栖姬都要服从这对姐妹，包括过去母亲创造的失败品女儿。无数深海栖姬称呼这对姐妹花为“深海之女”，无微不至地照顾这对姐妹花。
就这样时光流转，也许过去了一百年，也许过去了两百年，甚至可能是五百年。大海上开始出现了钢铁做的人类舰船，而这对姐妹记忆中人类还在使用简陋的风帆。
直到某一天，一批手持能喷射铁弹珠的人类闯进了姐妹两人居住的海岛。姐妹两人看到这么多人类，慌忙中发出求救呼喊。周围海域的深海栖姬全部靠近过来，但那时候的深海栖姬并没有武器概念，它们使用古老的宝石力量，毫不畏惧地向人类登陆舰队发起了攻击。
“皇国未来在此一战！掌握了砂之女神的力量，皇国将天下无敌。不用害怕黑色的怪物，枪弹能轻易杀死它们！”
人类中像是指挥官的人，高喊着这番话语。最初还害怕不已的士兵，立刻就组织起了密集的火力网，子弹与炮弹打在脱离舰体的深海栖姬身上，将昔日两姐妹的养育者们成批杀害。
几千年来没进行过大规模战斗的深海栖姬当然没见识过热兵器的杀伤力，还以为对方跟过去擅闯的土著渔民是一个战斗力级别。战斗变成了一面倒的屠杀，タルヌリチ五种深海栖姬的尸体堆满了半座海岛，它们没有畏惧的心理，因为敌人要伤害深海之女，所以依照深海的意志命令，要不惜一切代价保卫两姐妹。
“不要让怪物近身！保持阵型，射击！”
杀戮持续了整整两天，超过一万个深海栖姬倒在了海岛上，黑色的鲜血将整座海岛染成了黑色。
“Wo！Wo！Wo!!!”一只从其他海域赶来的ヲ成了最后能保卫两姐妹的深海栖姬，它是两姐妹模仿自己做的新型深海栖姬，能够在自己的帽子型器官里孵化出小型砂虫，这也是日本军人第一次遇到能远距离攻击的敌人。
“快把那只怪物干掉！”
有几名身穿白大褂的非军人混在军队里，对藏身在洞穴里的砂之女神的宝藏虎视眈眈。
科学家可以瞎指挥，前面战斗的士兵面对会自爆的危险毒虫，没一个敢上前，最后还是靠运来山炮，一顿乱轰把挡路的ヲ干掉。
“这可是没见过的深海栖姬，你们怎么能把它炸成碎片？”科学家还在向下达炮击的指挥官大呼小叫。但很快那群帝国研究院的科学家就安静了下来，进去搜查的士兵押着两个小女孩走出了洞穴。
“人类？”
年轻的研究院副院长北村教授首先上前检查，两个小女孩看起来像是黄种人，提取到的血液细胞和头皮细胞都跟人类不同。
更加让北村教授兴奋的是，他前几分钟采集血样在两个小女孩手上划了一刀，结果现在伤口已经愈合了。
很强的恢复能力。北村教授毫不客气地拿来一把长刀，一刀捅在其中一个女孩的腹部，将她的肠子截取了一段。然后神奇的事情再次发生，肠子自己慢慢连接起来，而腹部的创口也在十五分钟后彻底愈合。
没理会两个小女孩嚎啕大哭，北村教授又赶忙看了下取样的肠子，已经变成了黑灰。
“北村教授，你要做实验回去再进行吧。”一个七八岁大小的小孩子走出了人群，站在两姐妹面前。小孩带着黑色的头巾和一个黑铁面具，看不清容貌，甚至连声音都被面具处理过了。
“那些就是你最在乎的‘砂之宝石’吧？”
另一群士兵从洞穴里抬出了一袋子黄色宝石，在阳光下闪闪发亮。小孩清楚地知道那些宝石只是“深海之女”诞生时候破碎的茧。
“没错！就是这种神话中的宝石！”
不只是北村教授，其他研究院的人也都目光直愣愣盯着那袋宝石，恨不得将其放进自己的口袋。
“‘黑’大人，这次全靠你们海军出力，我们取得研究进展一定第一时间与海军合作分享。”
被称为“黑”的小孩，打量着两个小女孩。“我能感觉到这两个非人类生物蕴含了强大的力量，可别在研究中弄死了，北村教授。”
“是，一切听从‘黑’大人的命令。”
瑟瑟发抖的姐妹俩就这样被关在铁笼里，离开了她们生活的海岛，脱离了母亲的联系。
那一年是1895年，正值日本在第一次日中战争中大获全胜，丰厚的战争赔偿金使得日本海军得以与西方国家展开军备竞赛。
仅仅五年后，第一位舰娘诞生，传统士族出身的一名海军女军官成为了当时出云号的契约者，并且主动放弃自己的名字，改名出云。也是从那时起，舰娘开始陆续出现，并且在日俄海战一举成名。
1905年，脱离与深海的意志联系，两姐妹在冰冷的实验室里慢慢长大。北村院长派人教会了她们简单的人类社会知识，但从没把两姐妹当做人类看待。如果不是“黑”经常过来视察，他很可能已经偷偷把两姐妹做成标本研究了。
不过这一次，拜访研究院特秘7处的不是“黑”，而是一群有地位的政治家。包括当时的首相桂先生和元老西园寺先生，其余的人北村院长叫不出名字，毕竟他不关心政治。
接待的是北村教授的门生，他本人不待见非科学研究者。
“老师，他们想看看舰娘原体1号和2号。”
“随他们的便，反正现在能做的研究都已经完成，那两个原体也没多少研究价值。让那群政治家长长见识，说不定能意识到人类与神造生物的差距。”
北村院长已经把工作重心放在了完善舰娘性能上，契约者因为DNA改变后没法获得生育能力，让他头痛不已。即使“黑”大人不在意这点小瑕疵，契约者也不会因为失去生育后代的能力而退缩，但北村院长还是想做得尽善尽美。
北村院长并不知道他眼中没有剩余价值的两个原体，已经出现了多么惊人的变化。
只过了10年，1号姐姐拥有了强大的同化能力，包括金属和玻璃在内，任何物质都可以被她同化为深海生物，只是她并没过多展示这种能力，制造的产物也被她当做玩具变成碎片。
而2号妹妹获得了惊人的智力，研究人员计算一周才能得出的答案，她能在几分钟内算出，甚至于在十天掌握阿拉伯语，使用古日语仿写名家笔墨。
1号变得充满攻击性，并且精神失常，保持野兽一般的思考方式。而2号已经跟一名普通的女高中生差不多，每天自己穿着衣物，虽然性格冰冷，但还是会与研究人员保持交流。
在这种情况下，两姐妹见到了这个国家真正的掌权者，能够主导日本国未来的政坛领袖们。
“那个披头散发的女性是1号原体，而那个正在看书的女性是2号原体。”
隔着厚厚的玻璃，这群政坛大佬经过日俄海战了解了舰娘的强大，所以特地前来看看舰娘的原体是什么生物。结果看到也是普通的人类样子的女性，不由失望。
有人直截了当地发表了轻视话语，完全没了当初惊叹舰娘惊人战斗力时候的崇敬。
“也不过是两只手两条腿的人，我还以为是八爪鱼那样的怪物。”
“她们吃什么？白饭加秋刀鱼配一碗味增汤？那跟我孙女有什么区别？”
——
没有了好奇心，这群政坛大佬转而去了解人类变成舰娘后的身体强度变化，他们之中不少人打算把自家年轻女性送去成为舰娘，强化家族影响力。女性参军总归比不上男性，那么能成为舰娘，便是把家族中贡献小的成员发挥出几倍甚至几十倍的作用，何乐不为？
只有一个人因为注意到了一个细节而没离开，当时没落的近卫家贵族院议员——近卫文麿。虽然是五摄家长子，但他接受的家族已经落后同僚太多，而他本人也没能力独自走上政坛掌权。
吸引了近卫文麿的是2号原体正在阅读其父亲著作的书籍。“你能听懂我说话吗？”
一旁的研究院工作人员没有阻拦近卫文麿的举动，反正他没有人身危险就没事。
2号转过头，合上书，然后走到了玻璃前。“快跟上去，不然你会被你的同僚排挤的。”
“没关系，反正我就这点本事。”近卫文麿还是第一次被一个女儿年纪的少女好言相劝，他更想好好了解两位不同于人类的生物。
“你叫什么名字？能看懂人类的书？”
2号摇了摇头，“我没有名字，你也可以叫我2号。此外你们人类的文字不难理解。”
“为何你姐姐疯疯癫癫的？而你识字又有礼貌？”
2号转头看着自己姐姐制造出一个玩具ヲ，高兴地在墙角玩耍，不由露出了笑容。“她继承了母亲的力量，而我继承了母亲的智慧。”
“近卫君！西园寺老师找你！”
远处传来了另一位议员的喊声，近卫文麿只好赶忙前去，不过在离开前他还是对2号说了一句。“如果还有机会，我很想与你坐下来聊聊。我是你正在看的书籍作者的儿子，家父的书总爱让读者自己猜含义，要是有看不懂的地方，只管来找我。”
直到近卫文麿走远，2号的脸上表情消失，变回了过去的无机质。“我当然知道……”
事后半年，近卫文麿将2号收养为女儿，赐名晓，供其在吴市海军学院读书，从此舰娘中多了一位加贺。